吉因加tNGS新冠分型本地化交付产品上线

玉光芊旭

新冠病毒的流行及变异趋势，仍是国内乃至全球关注的重点。据中国疾控中心病毒病所披露，截至2022年12月18日，奥密克戎已经演变出709个亚分支，这些亚分支互相之间重组产生了72个毒株，XBB是这72个毒株里面的一种。目前，BA.5.2和BF.7仍在国内不同地区大流行，免疫逃逸能力更强的BQ.1和XBB也有入境的相关报道。新冠病毒的毒株多样、变异快速等特点，增加了感染患者诊疗的复杂度，同时重复感染及重组株感染的问题也对医疗资源带来了潜在冲击。

吉因加tNGS新冠分型产品
2022年12月26日，国务院联防联控机制印发《新型冠状病毒感染“乙类乙管”疫情监测方案》，要求依托全国哨点医院开展新冠感染监测，及时将病毒变异株全基因序列上报中国疾控中心病毒病所，为疫苗研制、核酸和抗原等诊断试剂评价提供科学依据。基于此，吉因加积极响应相关政策，依托病原NGS检测技术平台，推出新冠分型产品，助力新冠毒株精细分型及进化分析。

吉因加tNGS新冠分型产品，采用探针捕获结合高深度二代测序技术，对新冠病毒全基因组实现100%覆盖，并且对高频变异区（S蛋白）实现高密度探针设计，确保变异位点无漏检，实现新冠毒株精准分型和新毒株的分析。



产品特色

杂交捕获技术+探针特异性设计
采用探针捕获技术，结合平铺+叠瓦组合策略，可以实现：
1）覆盖度高：基因组覆盖全面，组装完整度高；
2）均一性好：低病毒载量下SNP、InDel精准检出。



探针设计叠瓦+平铺，确保基因组全覆盖，无间隔

权威分型数据库+专用分析流程
全面完整的新冠专用分析解读流程，参考不断更新的GISAID、NCBI Virus、NGDC三大新冠病毒基因序列“仓库”，结合Pangolin和Nextstrain分型数据库及吉因加自有数据，实现新冠病毒分型结果，突变位点，系统发育树及合并感染病原结果的全面报出。



报告部分内容展示：



本地化交付整体解决方案



呼吸病原靶向检测试剂盒
吉因加呼吸病原靶向检测囊括306种呼吸道常见感染病原体，在实现新冠分型的同时，检测合并感染病原体，为患者临床分级管理提供参考信息。



GIN16自动化工作站
文库构建、杂交捕获、质控、pooling及make DNB五个环节一站式自动化解决，较手动流程节约20h，节约1-2人，实现无人值守的"黑灯"实验室，满足临床高时效性要求。



国产化测序仪Gene+Seq-200
Gene+Seq-200在2019年获得NMPA医疗器械注册证，并于2022年初获批新增“RNA测序”适用范围。可用于DNA、RNA两种核酸类型的测序，实现新冠病毒在内的RNA及DNA病原检测。



Gene+BOX分析解读一体机
公司自主研发的全自动分析解读一体机，内置病原分析软件NMPA获批，依托Pangolin、Nextstrain分型软件、内嵌定期更新的分型数据库，无需联网，可直接读取新冠基因组数据、分型溯源数据，一键生成新冠分型结果及进化关系，并大力保障院端数据安全。