在1998年,古生物学家Rubén D. Martínez将这个化石进行叙述、命名,模式种是准将城南方棱齿龙(N. comodorensis)。属名意为“南方的棱齿龙”,种名则是以化石发现地附近的里瓦达维亚海军准将城为名。
南方棱齿龙的模式标本(编号PV 942)是一个部份身体骨骼,包含4个颈椎、7个背椎、5个荐椎、6个尾椎、4块肋骨碎片、部份左肩胛骨、部分肩胛鸟喙骨、一个右肱骨、左右尺骨、大部分左脚(除了足部)、右腓骨与距骨、以及13个指骨。因为椎弓并没有与脊椎骨固定在一起,所以南方棱齿龙的叙述者Rubén D. Martínez认为该化石来自于并未完全成长的个体。